© David Ausserhofer / MDC Bioinformatics and Omics Data Science Altuna Akalin Profil Team Veröffentlichungen Nachrichten Profil Team Veröffentlichungen Nachrichten Profil Informationen zu unserer Technologieplattform finden Sie auf der englischen Seite. Team Leiter Dr. Altuna Akalin 101: Berlin Institute for Medical System Biology Raum: 1.09 Altuna.Akalin@mdc-berlin.de +49 30 9406-4271 Wissenschaftler Nour Alkhoury Nour.Alkhoury@mdc-berlin.de Dr. Alexander Blume 101: Berlin Institute for Medical System Biology Raum: 1.08 Alexander.Blume@mdc-berlin.de +49 30 9406-1422 Dr. Vedran Franke Vedran.Franke@mdc-berlin.de Jacqueline Anne Jansen Jacqueline.Jansen@mdc-berlin.de Ahmet Sarigün 101: Berlin Institute for Medical System Biology Raum: 1.60 Ahmet.Sariguen@mdc-berlin.de Mohammed Maqsood Shaik MohammedMaqsood.Shaik@mdc-berlin.de Dr. Bora Uyar 101: Berlin Institute for Medical System Biology Raum: 1.60 Bora.Uyar@mdc-berlin.de +49 30 9406-1545 Technischer Assistent Ricardo Wurmus 101: Berlin Institute for Medical System Biology Raum: 1.60 Ricardo.Wurmus@mdc-berlin.de Mitarbeiter Sabrina Deter 101: Berlin Institute for Medical System Biology Raum: 1.02 sabrina.deter@mdc-berlin.de +49 30 9406-2920 Madalin Ionel Patrascu MadalinIonel.Patrascu@mdc-berlin.de Doktorand Aaron Kollotzek Aaron.Kollotzek@mdc-berlin.de Fabian Janosch Krüger FabianJanosch.Krueger@mdc-berlin.de Francesco Santini Francesco.Santini@mdc-berlin.de Taras Savchyn 101: Berlin Institute for Medical System Biology Raum: 1.82-89 Taras.Savchyn@mdc-berlin.de Student Jonas Freimuth Jonas.Freimuth@mdc-berlin.de Leonard Sima Veröffentlichungen 11. Dezember 2020 / Nat Commun Single-nucleus transcriptomics reveals functional compartmentalization in syncytial skeletal muscle cells M. Kim V. Franke B. Brandt E.D. Lowenstein V. Schöwel S. Spuler A. Akalin C. Birchmeier 01. Dezember 2020 / Ageing Res Rev Single-cell analyses of aging, inflammation and senescence B. Uyar D. Palmer A. Kowald H.M. Escobar I. Barrantes S. Möller A. Akalin G. Fuellen 05. Oktober 2020 / J Exp Med PDGFA-associated protein 1 protects mature B lymphocytes from stress-induced cell death and promotes antibody gene diversification V. Delgado-Benito M. Berruezo-Llacuna R. Altwasser W. Winkler D. Sundaravinayagam S. Balasubramanian M. Caganova R. Graf A. Rahjouei M.T. Henke M. Driesner L. Keller A. Prigione M. Janz A. Akalin M. Di Virgilio 01. September 2020 / Nat Chem Biol Single-molecule analysis reveals agonist-specific dimer formation of µ-opioid receptors J. Möller A. Isbilir T. Sungkaworn B. Osberg C. Karathanasis V. Sunkara E.O. Grushevskyi A. Bock P. Annibale M. Heilemann C. Schütte M.J. Lohse 13. Juli 2020 / Nat Commun Deep learning for genomics using Janggu W. Kopp R. Monti A. Tamburrini U. Ohler A. Akalin 01. Juli 2020 / Genome Res Functional annotation of human long noncoding RNAs via molecular phenotyping J.A. Ramilowski C.W. Yip S. Agrawal J.C. Chang Y. Ciani I.V. Kulakovskiy M. Mendez J.L.C. Ooi J.F. Ouyang N. Parkinson A. Petri L. Roos J. Severin K. Yasuzawa I. Abugessaisa A. Akalin I.V. Antonov E. Arner A. Bonetti H. Bono B. Borsari F. Brombacher C.J.F. Cameron C.V. Cannistraci R. Cardenas M. Cardon H. Chang J. Dostie L. Ducoli A. Favorov A. Fort D. Garrido N. Gil J. Gimenez R. Guler L. Handoko J. Harshbarger A. Hasegawa Y. Hasegawa K. Hashimoto N. Hayatsu P. Heutink T. Hirose E.L. Imada M. Itoh B. Kaczkowski A. Kanhere E. Kawabata H. Kawaji T. Kawashima S.T. Kelly M. Kojima N. Kondo H. Koseki T. Kouno A. Kratz M. Kurowska-Stolarska A.T.J. Kwon J. Leek A. Lennartsson M. Lizio F. López-Redondo J. Luginbühl S. Maeda V.J. Makeev L. Marchionni Y.A. Medvedeva A. Minoda F. Müller M. Muñoz-Aguirre M. Murata H. Nishiyori K.R. Nitta S. Noguchi Y. Noro R. Nurtdinov Y. Okazaki V. Orlando D. Paquette C.J.C. Parr O.J.L. Rackham P. Rizzu D.F. Sánchez Martinez A. Sandelin P. Sanjana C.A.M. Semple Y. Shibayama D.M. Sivaraman T. Suzuki S.C. Szumowski M. Tagami M.S. Taylor C. Terao M. Thodberg S. Thongjuea V. Tripathi I. Ulitsky R. Verardo I.E. Vorontsov C. Yamamoto R.S. Young J.K. Baillie A.R.R. Forrest R. Guigó M.M. Hoffman C.C. Hon T. Kasukawa S. Kauppinen J. Kere B. Lenhard C. Schneider H. Suzuki K. Yagi M.J.L. de Hoon J.W. Shin P. Carninci 23. Juni 2020 / Proc Natl Acad Sci U S A Functional interplay of Epstein-Barr virus oncoproteins in a mouse model of B cell lymphomagenesis T. Sommermann T. Yasuda J. Ronen T. Wirtz T. Weber U. Sack R. Caeser J. Zhang X. Li V.T. Chu A. Jauch K. Unger D.J. Hodson A. Akalin K. Rajewsky 01. April 2020 / Nutrients The association between salt taste perception, mediterranean diet and metabolic syndrome: a cross-sectional study N.N. Veček L. Mucalo R. Dragun T. Miličević A. Pribisalić I. Patarčić C. Hayward O. Polašek I. Kolčić 01. Januar 2020 Computational genomics with R A. Akalin 01. Dezember 2019 / Life Sci Allianc Evaluation of colorectal cancer subtypes and cell lines using deep learning J. Ronen S. Hayat A. Akalin Seitennummerierung Erste Seite « First Vorherige Seite ‹‹ … Seite 3 Aktuelle Seite 4 Seite 5 Seite 6 … Nächste Seite ›› Letzte Seite Last » Nachrichten Seitennummerierung Erste Seite « First Vorherige Seite ‹‹ Seite 1 Seite 2 Aktuelle Seite 3 Dr. Altuna Akalin Kontakt Altuna.Akalin@mdc-berlin.de Telefon: +49 30 9406-4271 Max-Delbrück-Centrum für Molekulare Medizin (MDC) Hannoversche Straße 28 10115 Berlin, Deutschland Gebäude 101, Raum 1.09
Team Leiter Dr. Altuna Akalin 101: Berlin Institute for Medical System Biology Raum: 1.09 Altuna.Akalin@mdc-berlin.de +49 30 9406-4271 Wissenschaftler Nour Alkhoury Nour.Alkhoury@mdc-berlin.de Dr. Alexander Blume 101: Berlin Institute for Medical System Biology Raum: 1.08 Alexander.Blume@mdc-berlin.de +49 30 9406-1422 Dr. Vedran Franke Vedran.Franke@mdc-berlin.de Jacqueline Anne Jansen Jacqueline.Jansen@mdc-berlin.de Ahmet Sarigün 101: Berlin Institute for Medical System Biology Raum: 1.60 Ahmet.Sariguen@mdc-berlin.de Mohammed Maqsood Shaik MohammedMaqsood.Shaik@mdc-berlin.de Dr. Bora Uyar 101: Berlin Institute for Medical System Biology Raum: 1.60 Bora.Uyar@mdc-berlin.de +49 30 9406-1545 Technischer Assistent Ricardo Wurmus 101: Berlin Institute for Medical System Biology Raum: 1.60 Ricardo.Wurmus@mdc-berlin.de Mitarbeiter Sabrina Deter 101: Berlin Institute for Medical System Biology Raum: 1.02 sabrina.deter@mdc-berlin.de +49 30 9406-2920 Madalin Ionel Patrascu MadalinIonel.Patrascu@mdc-berlin.de Doktorand Aaron Kollotzek Aaron.Kollotzek@mdc-berlin.de Fabian Janosch Krüger FabianJanosch.Krueger@mdc-berlin.de Francesco Santini Francesco.Santini@mdc-berlin.de Taras Savchyn 101: Berlin Institute for Medical System Biology Raum: 1.82-89 Taras.Savchyn@mdc-berlin.de Student Jonas Freimuth Jonas.Freimuth@mdc-berlin.de Leonard Sima
Veröffentlichungen 11. Dezember 2020 / Nat Commun Single-nucleus transcriptomics reveals functional compartmentalization in syncytial skeletal muscle cells M. Kim V. Franke B. Brandt E.D. Lowenstein V. Schöwel S. Spuler A. Akalin C. Birchmeier 01. Dezember 2020 / Ageing Res Rev Single-cell analyses of aging, inflammation and senescence B. Uyar D. Palmer A. Kowald H.M. Escobar I. Barrantes S. Möller A. Akalin G. Fuellen 05. Oktober 2020 / J Exp Med PDGFA-associated protein 1 protects mature B lymphocytes from stress-induced cell death and promotes antibody gene diversification V. Delgado-Benito M. Berruezo-Llacuna R. Altwasser W. Winkler D. Sundaravinayagam S. Balasubramanian M. Caganova R. Graf A. Rahjouei M.T. Henke M. Driesner L. Keller A. Prigione M. Janz A. Akalin M. Di Virgilio 01. September 2020 / Nat Chem Biol Single-molecule analysis reveals agonist-specific dimer formation of µ-opioid receptors J. Möller A. Isbilir T. Sungkaworn B. Osberg C. Karathanasis V. Sunkara E.O. Grushevskyi A. Bock P. Annibale M. Heilemann C. Schütte M.J. Lohse 13. Juli 2020 / Nat Commun Deep learning for genomics using Janggu W. Kopp R. Monti A. Tamburrini U. Ohler A. Akalin 01. Juli 2020 / Genome Res Functional annotation of human long noncoding RNAs via molecular phenotyping J.A. Ramilowski C.W. Yip S. Agrawal J.C. Chang Y. Ciani I.V. Kulakovskiy M. Mendez J.L.C. Ooi J.F. Ouyang N. Parkinson A. Petri L. Roos J. Severin K. Yasuzawa I. Abugessaisa A. Akalin I.V. Antonov E. Arner A. Bonetti H. Bono B. Borsari F. Brombacher C.J.F. Cameron C.V. Cannistraci R. Cardenas M. Cardon H. Chang J. Dostie L. Ducoli A. Favorov A. Fort D. Garrido N. Gil J. Gimenez R. Guler L. Handoko J. Harshbarger A. Hasegawa Y. Hasegawa K. Hashimoto N. Hayatsu P. Heutink T. Hirose E.L. Imada M. Itoh B. Kaczkowski A. Kanhere E. Kawabata H. Kawaji T. Kawashima S.T. Kelly M. Kojima N. Kondo H. Koseki T. Kouno A. Kratz M. Kurowska-Stolarska A.T.J. Kwon J. Leek A. Lennartsson M. Lizio F. López-Redondo J. Luginbühl S. Maeda V.J. Makeev L. Marchionni Y.A. Medvedeva A. Minoda F. Müller M. Muñoz-Aguirre M. Murata H. Nishiyori K.R. Nitta S. Noguchi Y. Noro R. Nurtdinov Y. Okazaki V. Orlando D. Paquette C.J.C. Parr O.J.L. Rackham P. Rizzu D.F. Sánchez Martinez A. Sandelin P. Sanjana C.A.M. Semple Y. Shibayama D.M. Sivaraman T. Suzuki S.C. Szumowski M. Tagami M.S. Taylor C. Terao M. Thodberg S. Thongjuea V. Tripathi I. Ulitsky R. Verardo I.E. Vorontsov C. Yamamoto R.S. Young J.K. Baillie A.R.R. Forrest R. Guigó M.M. Hoffman C.C. Hon T. Kasukawa S. Kauppinen J. Kere B. Lenhard C. Schneider H. Suzuki K. Yagi M.J.L. de Hoon J.W. Shin P. Carninci 23. Juni 2020 / Proc Natl Acad Sci U S A Functional interplay of Epstein-Barr virus oncoproteins in a mouse model of B cell lymphomagenesis T. Sommermann T. Yasuda J. Ronen T. Wirtz T. Weber U. Sack R. Caeser J. Zhang X. Li V.T. Chu A. Jauch K. Unger D.J. Hodson A. Akalin K. Rajewsky 01. April 2020 / Nutrients The association between salt taste perception, mediterranean diet and metabolic syndrome: a cross-sectional study N.N. Veček L. Mucalo R. Dragun T. Miličević A. Pribisalić I. Patarčić C. Hayward O. Polašek I. Kolčić 01. Januar 2020 Computational genomics with R A. Akalin 01. Dezember 2019 / Life Sci Allianc Evaluation of colorectal cancer subtypes and cell lines using deep learning J. Ronen S. Hayat A. Akalin Seitennummerierung Erste Seite « First Vorherige Seite ‹‹ … Seite 3 Aktuelle Seite 4 Seite 5 Seite 6 … Nächste Seite ›› Letzte Seite Last »
11. Dezember 2020 / Nat Commun Single-nucleus transcriptomics reveals functional compartmentalization in syncytial skeletal muscle cells M. Kim V. Franke B. Brandt E.D. Lowenstein V. Schöwel S. Spuler A. Akalin C. Birchmeier
01. Dezember 2020 / Ageing Res Rev Single-cell analyses of aging, inflammation and senescence B. Uyar D. Palmer A. Kowald H.M. Escobar I. Barrantes S. Möller A. Akalin G. Fuellen
05. Oktober 2020 / J Exp Med PDGFA-associated protein 1 protects mature B lymphocytes from stress-induced cell death and promotes antibody gene diversification V. Delgado-Benito M. Berruezo-Llacuna R. Altwasser W. Winkler D. Sundaravinayagam S. Balasubramanian M. Caganova R. Graf A. Rahjouei M.T. Henke M. Driesner L. Keller A. Prigione M. Janz A. Akalin M. Di Virgilio
01. September 2020 / Nat Chem Biol Single-molecule analysis reveals agonist-specific dimer formation of µ-opioid receptors J. Möller A. Isbilir T. Sungkaworn B. Osberg C. Karathanasis V. Sunkara E.O. Grushevskyi A. Bock P. Annibale M. Heilemann C. Schütte M.J. Lohse
13. Juli 2020 / Nat Commun Deep learning for genomics using Janggu W. Kopp R. Monti A. Tamburrini U. Ohler A. Akalin
01. Juli 2020 / Genome Res Functional annotation of human long noncoding RNAs via molecular phenotyping J.A. Ramilowski C.W. Yip S. Agrawal J.C. Chang Y. Ciani I.V. Kulakovskiy M. Mendez J.L.C. Ooi J.F. Ouyang N. Parkinson A. Petri L. Roos J. Severin K. Yasuzawa I. Abugessaisa A. Akalin I.V. Antonov E. Arner A. Bonetti H. Bono B. Borsari F. Brombacher C.J.F. Cameron C.V. Cannistraci R. Cardenas M. Cardon H. Chang J. Dostie L. Ducoli A. Favorov A. Fort D. Garrido N. Gil J. Gimenez R. Guler L. Handoko J. Harshbarger A. Hasegawa Y. Hasegawa K. Hashimoto N. Hayatsu P. Heutink T. Hirose E.L. Imada M. Itoh B. Kaczkowski A. Kanhere E. Kawabata H. Kawaji T. Kawashima S.T. Kelly M. Kojima N. Kondo H. Koseki T. Kouno A. Kratz M. Kurowska-Stolarska A.T.J. Kwon J. Leek A. Lennartsson M. Lizio F. López-Redondo J. Luginbühl S. Maeda V.J. Makeev L. Marchionni Y.A. Medvedeva A. Minoda F. Müller M. Muñoz-Aguirre M. Murata H. Nishiyori K.R. Nitta S. Noguchi Y. Noro R. Nurtdinov Y. Okazaki V. Orlando D. Paquette C.J.C. Parr O.J.L. Rackham P. Rizzu D.F. Sánchez Martinez A. Sandelin P. Sanjana C.A.M. Semple Y. Shibayama D.M. Sivaraman T. Suzuki S.C. Szumowski M. Tagami M.S. Taylor C. Terao M. Thodberg S. Thongjuea V. Tripathi I. Ulitsky R. Verardo I.E. Vorontsov C. Yamamoto R.S. Young J.K. Baillie A.R.R. Forrest R. Guigó M.M. Hoffman C.C. Hon T. Kasukawa S. Kauppinen J. Kere B. Lenhard C. Schneider H. Suzuki K. Yagi M.J.L. de Hoon J.W. Shin P. Carninci
23. Juni 2020 / Proc Natl Acad Sci U S A Functional interplay of Epstein-Barr virus oncoproteins in a mouse model of B cell lymphomagenesis T. Sommermann T. Yasuda J. Ronen T. Wirtz T. Weber U. Sack R. Caeser J. Zhang X. Li V.T. Chu A. Jauch K. Unger D.J. Hodson A. Akalin K. Rajewsky
01. April 2020 / Nutrients The association between salt taste perception, mediterranean diet and metabolic syndrome: a cross-sectional study N.N. Veček L. Mucalo R. Dragun T. Miličević A. Pribisalić I. Patarčić C. Hayward O. Polašek I. Kolčić
01. Dezember 2019 / Life Sci Allianc Evaluation of colorectal cancer subtypes and cell lines using deep learning J. Ronen S. Hayat A. Akalin
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